Główne obszary działalności naukowej Instytutu Zarządzania i Systemów Informatycznych dotyczą:

• strategii przedsiębiorstw,
• planowania biznesu,
• systemów budżetowania,
• struktur organizacyjnych, w tym struktur procesowych,
• systemów informacyjnych zarządzania,
• systemów informatycznych wspomagających zarządzanie,
• lean management (szczupłego przedsiębiorstwa),
• agile enterprise (zwinnego przedsiębiorstwa),
• przedsiębiorstwa wirtualnego,
• barier i ryzyka w działalności małych i średnich przedsiębiorstw;
• zarządzania małym i średnim przedsiębiorstwem w warunkach kryzysu,
• analizy ekonomicznej w procesie zarządzania nowoczesnym przedsiębiorstwem,
• konkurencyjności i innowacyjności Polski i polskich przedsiębiorstw na tle krajów rozwiniętych,
• sieci biznesowych - klastrów, aliansów strategicznych i powiązań kooperacyjnych,
• współpracy przedsiębiorstw z jednostkami sektora publicznego,
• marketingu internetowego i jego roli w zarządzaniu innowacyjnym przedsiębiorstwem,
• kapitału ludzkiego i społecznego w kreowaniu innowacyjnej przedsiębiorczości,
• komunikacji w biznesie w działalności MSP,
• negocjacji i technik negocjacyjnych,
• zarządzania zasobami ludzkimi, projektowania profili kompetencyjnych, budowania zespołów zadaniowych,
• etyki w biznesie.